More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3780 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 403 aa  790    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  67.25 
 
 		 406 aa  508  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  56.03 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  56.31 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  56.81 
 
 		 625 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  61.27 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  59.4 
 
 		 403 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  56.58 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  58.16 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  57.99 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  56.3 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  54.52 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 409 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  56.27 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  52.69 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 442 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  46.68 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  46.6 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  47.38 
 
 		 396 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  44.33 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  47.73 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  46.1 
 
 		 403 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  47.13 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  45.92 
 
 		 410 aa  339  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  44.94 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  46.43 
 
 		 398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  44.07 
 
 		 402 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  52.25 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  45.92 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  44.1 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  47.8 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  44.09 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  47.14 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  43.57 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  45.24 
 
 		 416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  43.65 
 
 		 397 aa  329  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  44.97 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  50.68 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  44.97 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  42.59 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  43.15 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  44.64 
 
 		 404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  52.05 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 407 aa  326  6e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  43.33 
 
 		 422 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  43.59 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  43.33 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  43.33 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  43.31 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  43.33 
 
 		 422 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  43.08 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  43.08 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  42.82 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  43.92 
 
 		 422 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  44.18 
 
 		 422 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  43.92 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  43.92 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  43.92 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  39.12 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  38.38 
 
 		 400 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  43.29 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  40.43 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.17 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  45.57 
 
 		 245 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  35.89 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 405 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 406 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 362 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  32.03 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.58 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 373 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.42 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  34.75 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>