More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0409 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  900    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  29.38 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  29.38 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.74 
 
 		 409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  28.15 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  28.47 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  28.28 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  27.87 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  27.18 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  27.8 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  26.83 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 407 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  28.07 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  27.8 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  27.8 
 
 		 396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  27.01 
 
 		 410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  26.96 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  26.35 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  27.01 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 405 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.14 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  26.81 
 
 		 403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  30.89 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  26.59 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  25.06 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  24.81 
 
 		 410 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  25.53 
 
 		 425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  25.58 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  25.58 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  25.58 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  24.74 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  24.74 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  27.63 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  24.74 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  26.98 
 
 		 625 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  24.49 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  24.49 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  24.23 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  25.32 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  24.49 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  24.49 
 
 		 422 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  25.32 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  25.25 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  25.32 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.86 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.27 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  25.4 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  27.67 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  25.5 
 
 		 396 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.89 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  24.87 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25.19 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  26.68 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  26.53 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  26.63 
 
 		 402 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  22.17 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  29.03 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 374 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  27.6 
 
 		 245 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.64 
 
 		 373 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 373 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.01 
 
 		 503 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 478 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>