205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0633 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  100 
 
 		 378 aa  775    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  55.2 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  48.79 
 
 		 371 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  48.4 
 
 		 368 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  45.58 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  45.36 
 
 		 368 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 367 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 		 368 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  44.79 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  48.66 
 
 		 368 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 367 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  44.53 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  47.59 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  44.44 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 		 370 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  43.8 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  43.8 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  43.8 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  43.8 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  43.8 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  43.8 
 
 		 373 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  43.8 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  43.65 
 
 		 369 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 		 369 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.73 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.21 
 
 		 368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  44.95 
 
 		 368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  44.35 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 368 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  45.72 
 
 		 367 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  42.48 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 364 aa  298  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  44.69 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  43.84 
 
 		 366 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  40.36 
 
 		 383 aa  292  5e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  45.03 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  44.02 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  47.33 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 		 371 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  38.71 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 362 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  38.08 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  36.1 
 
 		 406 aa  203  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  28.83 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  28.04 
 
 		 427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  28.29 
 
 		 625 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  28.08 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  32.36 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  31.54 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  26.36 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  25.76 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  31.67 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  27.18 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 500 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 401 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 396 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  26.29 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  26.36 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 485 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.04 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.78 
 
 		 503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  27.78 
 
 		 489 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  25.43 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  27.32 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>