More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0387 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  89.4 
 
 		 368 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 368 aa  740    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  95.92 
 
 		 368 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  73.84 
 
 		 373 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  73.22 
 
 		 369 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  73.71 
 
 		 369 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  73.71 
 
 		 369 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  73.71 
 
 		 369 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  74.1 
 
 		 366 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  71.54 
 
 		 369 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  71.27 
 
 		 369 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  72.21 
 
 		 373 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  71.93 
 
 		 373 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  71.93 
 
 		 373 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  71.93 
 
 		 373 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  71.93 
 
 		 373 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  71.66 
 
 		 373 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  71.66 
 
 		 373 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  63.22 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  64.54 
 
 		 367 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  63.86 
 
 		 368 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  63.01 
 
 		 368 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  62.84 
 
 		 364 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  58.68 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  62.19 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  58.9 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  60.93 
 
 		 371 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  61.85 
 
 		 367 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  62.36 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  58.4 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 372 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  62.36 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  57.26 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  61.64 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  60.44 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  60.65 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  57.3 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  62.74 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  56.67 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  56.04 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  56.67 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  60.56 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  58.61 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  51.75 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  58.89 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  56.08 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  54.76 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  53.48 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  55.99 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  56.58 
 
 		 372 aa  359  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  53.3 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  50.55 
 
 		 369 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 375 aa  342  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 376 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 371 aa  339  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  54.14 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  52.6 
 
 		 368 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  45.38 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  44.68 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.95 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  40.81 
 
 		 362 aa  272  9e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  38.95 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  35.46 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 496 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 479 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 403 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  38.6 
 
 		 625 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  36.64 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.62 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 412 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 493 aa  142  9e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 485 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  35.42 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  32.97 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  35.25 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  35.25 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  32.6 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 398 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  27.2 
 
 		 473 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  29.47 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  31.64 
 
 		 404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  28.64 
 
 		 404 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  36.65 
 
 		 396 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  36.82 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  36.88 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  29.4 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>