220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4934 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
372 aa  743    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  61.33 
 
 
364 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  60.22 
 
 
364 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  57.26 
 
 
367 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  57.73 
 
 
374 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 
371 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  55.91 
 
 
368 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  58.86 
 
 
366 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  56.22 
 
 
368 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  58.24 
 
 
372 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 
378 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  58.72 
 
 
365 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  56.52 
 
 
368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  55.92 
 
 
366 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  55.89 
 
 
371 aa  361  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  56.79 
 
 
368 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  55.65 
 
 
369 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  54.25 
 
 
369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  54.25 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  55.92 
 
 
373 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  54.79 
 
 
369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  54.79 
 
 
369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  54.79 
 
 
369 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 
367 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
368 aa  353  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  56.4 
 
 
366 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  53.8 
 
 
366 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  52.91 
 
 
367 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  57.18 
 
 
364 aa  348  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  55.43 
 
 
368 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  55.43 
 
 
367 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  51.87 
 
 
371 aa  346  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  53.1 
 
 
369 aa  345  5e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.79 
 
 
373 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.79 
 
 
373 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.79 
 
 
373 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  54.79 
 
 
373 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.79 
 
 
373 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  56.37 
 
 
364 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  54.52 
 
 
373 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  53.01 
 
 
364 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  54.52 
 
 
373 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 
368 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  55.03 
 
 
373 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 
367 aa  338  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  58.11 
 
 
380 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  51.62 
 
 
370 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  53.01 
 
 
369 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  53.69 
 
 
366 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 
370 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  52.15 
 
 
371 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  53.1 
 
 
371 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  51.64 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  46.49 
 
 
383 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 
372 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  49.33 
 
 
368 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 
376 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 
374 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  46.34 
 
 
375 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  47.98 
 
 
368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  47.26 
 
 
363 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  41.6 
 
 
373 aa  261  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  42.23 
 
 
378 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  38.16 
 
 
406 aa  212  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  35.1 
 
 
447 aa  193  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
485 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  27.15 
 
 
473 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  31.05 
 
 
625 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
394 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  30.59 
 
 
427 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  36.56 
 
 
396 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  35.71 
 
 
406 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  31 
 
 
396 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  35.61 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  27.3 
 
 
476 aa  119  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
403 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  30.89 
 
 
402 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
965 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
479 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 
442 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  29.79 
 
 
427 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.3 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  28.4 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  30.1 
 
 
398 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  30.29 
 
 
511 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
493 aa  113  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  33.33 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  28.43 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  33.33 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  30.4 
 
 
407 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>