196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06700 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  912    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 
374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
367 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
366 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 
364 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.99 
 
 
373 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
369 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
366 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
369 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
369 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
369 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
369 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
371 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
368 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.53 
 
 
378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.28 
 
 
373 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
373 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.28 
 
 
373 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.28 
 
 
373 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.28 
 
 
373 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.28 
 
 
373 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  33.41 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  34.75 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
363 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 
370 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
362 aa  193  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
364 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 
364 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
368 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
372 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
368 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
375 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
378 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  36.11 
 
 
371 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
371 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.49 
 
 
366 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
371 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
368 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.58 
 
 
368 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  34.43 
 
 
368 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
372 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
372 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  32.63 
 
 
383 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
367 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  35.05 
 
 
373 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
368 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
371 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
369 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  29.33 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
365 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
380 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
376 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
374 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
364 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
364 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.21 
 
 
409 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 
404 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  27.31 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  27.31 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  27.13 
 
 
404 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  26.59 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  28.34 
 
 
397 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  26.54 
 
 
402 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  27.65 
 
 
398 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
400 aa  123  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  26.53 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  27.46 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  29.02 
 
 
427 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  27.69 
 
 
396 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
398 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  27.25 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
394 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  26.39 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
479 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 
479 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  26.42 
 
 
427 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
403 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
400 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25.18 
 
 
399 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
479 aa  106  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  24.77 
 
 
416 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>