284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0823 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
371 aa  742    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  65.48 
 
 
369 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  54.9 
 
 
364 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  53.78 
 
 
364 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  50.69 
 
 
368 aa  359  3e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  51.4 
 
 
367 aa  355  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 
370 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 
367 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 
380 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  53.02 
 
 
366 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 
369 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 
369 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 
369 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
374 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  53.89 
 
 
364 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  48.63 
 
 
368 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  53.61 
 
 
364 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  49.86 
 
 
366 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  51.87 
 
 
372 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 
369 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  51.45 
 
 
366 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  48.61 
 
 
368 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 
364 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1240  FAD dependent oxidoreductase  51 
 
 
367 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 
368 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 
367 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.95 
 
 
373 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1428  FAD dependent oxidoreductase  51.44 
 
 
368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.085376  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  49.31 
 
 
367 aa  325  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.37 
 
 
368 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  49.85 
 
 
372 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 
368 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 
371 aa  324  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.4 
 
 
373 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  47.4 
 
 
373 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.4 
 
 
373 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.4 
 
 
373 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.4 
 
 
373 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  47.4 
 
 
373 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  47.4 
 
 
373 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3387  FAD dependent oxidoreductase  50.29 
 
 
365 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1451  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 
371 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 
378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4647  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.54 
 
 
371 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  47.4 
 
 
371 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1030  hypothetical protein  48.29 
 
 
373 aa  299  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.950675  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
369 aa  297  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 
370 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 
376 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  45.41 
 
 
375 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  43.17 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  42.43 
 
 
374 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  40.16 
 
 
383 aa  265  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  44.9 
 
 
363 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  44.54 
 
 
368 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0633  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  39.07 
 
 
378 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  36.93 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
362 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41267  glycerol-3-phospate dehydrogenase  37.05 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.847058  normal  0.0947149 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06700  conserved hypothetical protein  32.15 
 
 
447 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
409 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
479 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
400 aa  126  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  31.51 
 
 
396 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  34.91 
 
 
625 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.82 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  27.48 
 
 
404 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.99 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
398 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  32.18 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  24.87 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  32.18 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  30.48 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  32.63 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  28.42 
 
 
511 aa  113  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  29.95 
 
 
427 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
494 aa  113  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  29.79 
 
 
427 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
407 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  27.23 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  32.62 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  32.49 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  32.39 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  32.06 
 
 
396 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  29.94 
 
 
397 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
496 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
485 aa  110  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  24.86 
 
 
473 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  28.69 
 
 
489 aa  109  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>