More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0283 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
475 aa  961    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  50.53 
 
 
479 aa  449  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  44.91 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  38.22 
 
 
489 aa  338  9e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
476 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  40.5 
 
 
476 aa  332  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 
494 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.32 
 
 
503 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 
484 aa  315  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 
500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 
479 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 
478 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
493 aa  299  8e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  38.14 
 
 
473 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
473 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
479 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
485 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
965 aa  267  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  32.46 
 
 
511 aa  256  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.3 
 
 
472 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
491 aa  230  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  30.06 
 
 
508 aa  229  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
470 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
473 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
473 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
464 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
576 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
461 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
461 aa  201  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  32.48 
 
 
387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
465 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  28.09 
 
 
396 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  26 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  26 
 
 
464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  28.24 
 
 
427 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  37.22 
 
 
698 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
367 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  27.36 
 
 
427 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
374 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
368 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.21 
 
 
371 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
375 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
371 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.45 
 
 
373 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
362 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
380 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.36 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  27.79 
 
 
422 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  27.72 
 
 
422 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  27.79 
 
 
422 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  27.72 
 
 
422 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  27.45 
 
 
422 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.53 
 
 
373 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.53 
 
 
373 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
373 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.53 
 
 
373 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.53 
 
 
373 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  27.72 
 
 
422 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.53 
 
 
373 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
373 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  27.52 
 
 
422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  27.52 
 
 
422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
368 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
406 aa  114  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
370 aa  113  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  29.1 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  24.81 
 
 
625 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  26.37 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  29.1 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  26.36 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
371 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  27.34 
 
 
400 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  25.99 
 
 
404 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 
369 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  30.74 
 
 
397 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
364 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  25.26 
 
 
383 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
371 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  24.47 
 
 
399 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  27.81 
 
 
396 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  29.37 
 
 
397 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
367 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>