276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1375 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
461 aa  923    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 
479 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
479 aa  207  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 
494 aa  202  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
475 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
479 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
476 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.67 
 
 
476 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  29.75 
 
 
489 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
480 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
500 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  28.48 
 
 
473 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  28.6 
 
 
508 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
491 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
479 aa  173  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
493 aa  169  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
496 aa  169  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.84 
 
 
472 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
473 aa  166  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
485 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.31 
 
 
503 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
478 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  29.6 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
965 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
464 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  33.1 
 
 
698 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  25 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  25 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  28.64 
 
 
396 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
375 aa  97.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
465 aa  94  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  27.15 
 
 
383 aa  93.6  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
370 aa  93.2  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
367 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
366 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  24.53 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.82 
 
 
368 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.17 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  25.25 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.72 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.72 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.72 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.72 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.72 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  26.7 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.3 
 
 
371 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.45 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  27.22 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24.87 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  24.8 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.7 
 
 
403 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  28.92 
 
 
403 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  26.88 
 
 
400 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.24 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3956  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.792256  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  25.65 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
380 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  26.35 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.47 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  31.44 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>