More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3394 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 576 aa  1184    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  43.64 
 
 		 508 aa  412  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.16 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 500 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 476 aa  323  5e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 479 aa  319  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 		 478 aa  302  9e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  36.36 
 
 		 489 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 478 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 494 aa  279  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  36.9 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 473 aa  269  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  32.67 
 
 		 511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 491 aa  253  6e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 480 aa  252  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 965 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.6 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 461 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  30 
 
 		 464 aa  170  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 464 aa  163  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  25.6 
 
 		 465 aa  163  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  27.57 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  30.49 
 
 		 698 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  27.33 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  22.94 
 
 		 437 aa  98.6  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  24.87 
 
 		 373 aa  94  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.78 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.78 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.78 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.78 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 367 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25.9 
 
 		 396 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  25.78 
 
 		 373 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  24.3 
 
 		 400 aa  91.3  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 373 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 368 aa  91.3  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  20.81 
 
 		 572 aa  90.5  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  24.68 
 
 		 407 aa  90.5  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  23.21 
 
 		 556 aa  90.5  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  25.25 
 
 		 404 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  24.88 
 
 		 397 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.21 
 
 		 409 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 559 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  22.31 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 394 aa  87.8  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  23.72 
 
 		 402 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 496 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  24.51 
 
 		 402 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  26.13 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 408 aa  86.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 407 aa  86.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  26.13 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  33.04 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  22.71 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.26 
 
 		 409 aa  86.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  24.23 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 399 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  25.74 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  25.92 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  24.05 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  23.26 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  26.35 
 
 		 625 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  23.98 
 
 		 552 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 406 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  23.37 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  22.46 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>