More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2696 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
465 aa  960    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  52.18 
 
 
464 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  53.92 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
470 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  39.87 
 
 
472 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  40.09 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
461 aa  308  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
465 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
478 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
500 aa  236  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
496 aa  232  9e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
485 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
479 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
479 aa  226  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.51 
 
 
503 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  27.25 
 
 
473 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
965 aa  209  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
476 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  27.95 
 
 
489 aa  207  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.32 
 
 
476 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
491 aa  205  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
478 aa  202  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
479 aa  201  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
473 aa  199  6e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
494 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  32.03 
 
 
437 aa  186  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  27.75 
 
 
511 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
475 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 
576 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  24.73 
 
 
508 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  25 
 
 
387 aa  125  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
367 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
366 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
374 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 
374 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.76 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.76 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  29.49 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.76 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  29.49 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.76 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.76 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
367 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
368 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
375 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.95 
 
 
373 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
367 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
461 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  26.86 
 
 
383 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
364 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
369 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
369 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
369 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
369 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 
366 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
362 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.57 
 
 
409 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  27.11 
 
 
698 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
369 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
371 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
371 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.08 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  25.51 
 
 
552 aa  97.1  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  26.8 
 
 
404 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  26.12 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
367 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
364 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  26.84 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  26.84 
 
 
410 aa  94  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.78 
 
 
404 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 
368 aa  93.6  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
407 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  27.57 
 
 
403 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  29.04 
 
 
398 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 
378 aa  92  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 
366 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.3 
 
 
366 aa  91.3  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.23 
 
 
368 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
364 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
376 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1595  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0479283  normal  0.966875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  27.95 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
368 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  28.34 
 
 
422 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  25.56 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  25.56 
 
 
396 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>