265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38067 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  100 
 
 
698 aa  1452    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  36.16 
 
 
476 aa  187  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
476 aa  184  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
500 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  49.21 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  35.64 
 
 
489 aa  174  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
479 aa  160  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 
491 aa  160  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
478 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
485 aa  157  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
479 aa  157  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  41.45 
 
 
473 aa  157  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
494 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.54 
 
 
503 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 
479 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
479 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 
478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
484 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
493 aa  145  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 
496 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  38.38 
 
 
965 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 
473 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  37.22 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.18 
 
 
472 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
576 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
465 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  29.49 
 
 
508 aa  120  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
464 aa  118  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  29.58 
 
 
396 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 
461 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
473 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
473 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
470 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
465 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  30.73 
 
 
464 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
464 aa  94.4  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
442 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  31.58 
 
 
408 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  30.23 
 
 
387 aa  89  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
366 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
403 aa  88.2  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
364 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  30.89 
 
 
402 aa  84  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
412 aa  84  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  34.16 
 
 
625 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
369 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.33 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  30.37 
 
 
402 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  29.89 
 
 
427 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
369 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.67 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.67 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
364 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.67 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.67 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.67 
 
 
373 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2610  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
364 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.198369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
368 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  29.9 
 
 
427 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
369 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
369 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
369 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
380 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
374 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 
366 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
367 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  29.82 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  29.69 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
405 aa  77  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  31.44 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
400 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  33.57 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  28.03 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0823  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  31.17 
 
 
398 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
368 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>