More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50137 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  100 
 
 		 437 aa  902    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.89 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 465 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  30.47 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 476 aa  156  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 476 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.86 
 
 		 503 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 479 aa  153  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 479 aa  153  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  26.06 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  25.81 
 
 		 489 aa  140  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 493 aa  140  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 494 aa  140  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 479 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  23.7 
 
 		 511 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 475 aa  116  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  23.11 
 
 		 576 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 965 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  25.19 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  28.37 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 366 aa  100  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 370 aa  99.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 378 aa  97.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  26.64 
 
 		 410 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  26.64 
 
 		 410 aa  96.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 368 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  27.91 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  27.78 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  27.78 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.66 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 367 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  26.19 
 
 		 368 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  27.13 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  26.74 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  24.79 
 
 		 366 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  27.13 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  27.36 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  23.87 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 376 aa  90.9  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  28.63 
 
 		 410 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  26.57 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  27.08 
 
 		 396 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  28.81 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  26.36 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  28.24 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 422 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  25.19 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  24.94 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4544  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 		 372 aa  86.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  24.94 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 367 aa  86.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  24.94 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  27.13 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  27.13 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  23.94 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  26.37 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  24.94 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.27 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  24.94 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  26.6 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2833  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0535368 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2640  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>