More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3930 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  82.28 
 
 
470 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  81.5 
 
 
473 aa  743    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  87.31 
 
 
465 aa  786    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  81.5 
 
 
473 aa  743    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
461 aa  917    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  70.54 
 
 
472 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  39.51 
 
 
464 aa  299  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
500 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 
465 aa  282  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
496 aa  276  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
485 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
479 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 
503 aa  262  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  33.48 
 
 
489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  31.64 
 
 
476 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  31.64 
 
 
476 aa  257  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
479 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
478 aa  245  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  31.38 
 
 
473 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  33.56 
 
 
965 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  36.46 
 
 
396 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
493 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
473 aa  227  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 
479 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
480 aa  224  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
484 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  33.05 
 
 
511 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
475 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
491 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  27.49 
 
 
508 aa  187  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
576 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  29.44 
 
 
437 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  28.35 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
362 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  28.21 
 
 
698 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.78 
 
 
371 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.49 
 
 
373 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
371 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.49 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.49 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.49 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.49 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.49 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
368 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
380 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0628  putative FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
374 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  30.55 
 
 
366 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
367 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1005  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
368 aa  104  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.179288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
371 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
366 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
406 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
367 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5430  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
364 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
369 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0222  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
364 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
366 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
374 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  26.23 
 
 
383 aa  100  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
370 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
369 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
369 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
369 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0012  FAD-dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0012  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  22.27 
 
 
464 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
370 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  26.08 
 
 
373 aa  97.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  28.49 
 
 
556 aa  96.7  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0106  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  29.89 
 
 
368 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4334  putative FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
400 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
368 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  24.85 
 
 
552 aa  94.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  26.99 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
403 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  27.51 
 
 
625 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
376 aa  90.5  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  27.89 
 
 
556 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  27.41 
 
 
409 aa  90.1  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
394 aa  90.1  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  26.94 
 
 
416 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  27.92 
 
 
396 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>