More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4148 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  62.85 
 
 
560 aa  680    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  71.61 
 
 
542 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  71.61 
 
 
542 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.61 
 
 
542 aa  778    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  84.81 
 
 
547 aa  934    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.38 
 
 
542 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.97 
 
 
542 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.31 
 
 
547 aa  698    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  100 
 
 
556 aa  1137    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.57 
 
 
542 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.38 
 
 
542 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.43 
 
 
542 aa  775    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  82.08 
 
 
552 aa  897    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.57 
 
 
542 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.57 
 
 
542 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  78.56 
 
 
551 aa  854    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  78.19 
 
 
551 aa  849    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  74.22 
 
 
542 aa  795    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  70.17 
 
 
562 aa  760    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  71.61 
 
 
542 aa  778    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.61 
 
 
542 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  98.02 
 
 
556 aa  1118    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.61 
 
 
542 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  77.7 
 
 
547 aa  854    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  71.61 
 
 
542 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  53.73 
 
 
552 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 
559 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 
533 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  42.91 
 
 
556 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.52 
 
 
535 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.07 
 
 
556 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.23 
 
 
556 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.01 
 
 
556 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 
522 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 
516 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.57 
 
 
572 aa  363  6e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.81 
 
 
512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.67 
 
 
585 aa  350  3e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
539 aa  349  7e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  38.97 
 
 
582 aa  341  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
435 aa  281  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 
407 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 
384 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
392 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 
408 aa  252  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 
389 aa  252  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
545 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
545 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
432 aa  237  3e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 
424 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
486 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
543 aa  181  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
574 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
556 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
545 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
562 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
525 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
578 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
585 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
582 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.41 
 
 
567 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
581 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
575 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
576 aa  144  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
579 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
584 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.87 
 
 
554 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
519 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
577 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.26 
 
 
591 aa  137  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  31.84 
 
 
585 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
552 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.08 
 
 
605 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.29 
 
 
525 aa  135  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
573 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
559 aa  133  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.35 
 
 
551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
559 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.92 
 
 
532 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
533 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
560 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.79 
 
 
587 aa  130  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 
582 aa  130  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>