More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4821 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  69.01 
 
 
579 aa  764    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  76.02 
 
 
587 aa  827    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  65.66 
 
 
575 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  80.07 
 
 
576 aa  845    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  71.97 
 
 
579 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  60.78 
 
 
600 aa  640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
581 aa  1166    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 
569 aa  695    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  85.13 
 
 
585 aa  957    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  61.28 
 
 
578 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  91.03 
 
 
579 aa  981    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  91.21 
 
 
579 aa  983    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  78.45 
 
 
582 aa  889    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  91.03 
 
 
579 aa  981    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  93.85 
 
 
585 aa  995    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  61.62 
 
 
577 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  59.57 
 
 
568 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  61.33 
 
 
567 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  62.43 
 
 
552 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  61.61 
 
 
593 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  58.01 
 
 
574 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 
595 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  58.14 
 
 
579 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  59.18 
 
 
583 aa  613  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58 
 
 
605 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  59.09 
 
 
574 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  58.65 
 
 
572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  58.65 
 
 
573 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.43 
 
 
554 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  56.53 
 
 
573 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  56.26 
 
 
584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  55.71 
 
 
603 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  55.63 
 
 
639 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  53.68 
 
 
582 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.56 
 
 
585 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  52.29 
 
 
603 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 
582 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  50.18 
 
 
582 aa  506  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  52.08 
 
 
582 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  48.92 
 
 
567 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.7 
 
 
591 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.9 
 
 
583 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  46.24 
 
 
562 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  43.29 
 
 
581 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 
583 aa  346  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
557 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 
546 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.59 
 
 
559 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 
543 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 
560 aa  299  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 
559 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
525 aa  297  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
539 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 
516 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.43 
 
 
532 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
566 aa  294  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
531 aa  292  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
552 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.82 
 
 
530 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
559 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.17 
 
 
525 aa  288  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
542 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.54 
 
 
545 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
537 aa  286  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
534 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 
547 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 
529 aa  283  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 
532 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 
532 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 
533 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
519 aa  281  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
543 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 
546 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
536 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 
519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
528 aa  270  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
543 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
524 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
548 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
519 aa  263  8e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 
556 aa  262  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  32.96 
 
 
520 aa  260  4e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  32.82 
 
 
700 aa  259  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 
567 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
518 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
538 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 
564 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 
540 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
550 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.82 
 
 
522 aa  250  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  37.06 
 
 
602 aa  250  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  33.89 
 
 
543 aa  248  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
576 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 
557 aa  247  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.95 
 
 
560 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.31 
 
 
557 aa  243  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.95 
 
 
560 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>