More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2102 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  100 
 
 
512 aa  1038    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  52.34 
 
 
539 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 
516 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  52.73 
 
 
522 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 
514 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.7 
 
 
552 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.41 
 
 
560 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 
559 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  42.05 
 
 
533 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.75 
 
 
547 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.56 
 
 
547 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.57 
 
 
542 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.55 
 
 
551 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.23 
 
 
547 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.26 
 
 
551 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  39.57 
 
 
542 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.51 
 
 
556 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.77 
 
 
542 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.61 
 
 
542 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.89 
 
 
552 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.41 
 
 
556 aa  359  8e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.22 
 
 
542 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.22 
 
 
542 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.41 
 
 
556 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.03 
 
 
542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.03 
 
 
542 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.03 
 
 
542 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
556 aa  356  5e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.89 
 
 
535 aa  349  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.15 
 
 
572 aa  348  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.52 
 
 
556 aa  347  2e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.45 
 
 
556 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  37.7 
 
 
562 aa  344  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.81 
 
 
585 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.49 
 
 
582 aa  343  5.999999999999999e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 
384 aa  294  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 
435 aa  268  1e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
389 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
392 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
432 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
424 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
408 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 
545 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
545 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
545 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
545 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
547 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
543 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.87 
 
 
585 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
603 aa  126  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
574 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
556 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
546 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.1 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
573 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
574 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.88 
 
 
605 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.22 
 
 
554 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.34 
 
 
525 aa  108  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 
496 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
582 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
576 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
573 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 
578 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.92 
 
 
530 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 
479 aa  103  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.75 
 
 
551 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 
552 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
600 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.67 
 
 
506 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 
516 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
569 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.3 
 
 
581 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.06 
 
 
506 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
584 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.2 
 
 
509 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
593 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
559 aa  100  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.1 
 
 
526 aa  100  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
568 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
582 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
545 aa  99.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
575 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
579 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.81 
 
 
567 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.72 
 
 
510 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
543 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.14 
 
 
522 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>