More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2333 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 546 aa  1096    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.9 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 		 523 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  47.58 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 527 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 526 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.81 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 551 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 		 523 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 566 aa  252  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 532 aa  250  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 532 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 543 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 556 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.6 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.51 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 564 aa  236  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 567 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 545 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 534 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 533 aa  229  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 546 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.45 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.29 
 
 		 585 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 573 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 516 aa  223  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 		 557 aa  223  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.2 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 569 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 546 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 518 aa  220  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 552 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.48 
 
 		 551 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.21 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 550 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.32 
 
 		 516 aa  217  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 577 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.81 
 
 		 514 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  33.5 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.77 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.8 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 		 603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 536 aa  213  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 554 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 575 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.91 
 
 		 560 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 600 aa  212  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.78 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.78 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.78 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.13 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.78 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.98 
 
 		 587 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.66 
 
 		 510 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.78 
 
 		 560 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 574 aa  210  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 576 aa  209  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.58 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  31.73 
 
 		 609 aa  207  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.58 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.45 
 
 		 557 aa  207  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 520 aa  207  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 537 aa  207  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 		 513 aa  207  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.04 
 
 		 509 aa  207  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 560 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  34.94 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 		 532 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.77 
 
 		 502 aa  204  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.59 
 
 		 605 aa  204  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  30.45 
 
 		 559 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  27.49 
 
 		 520 aa  203  5e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.19 
 
 		 503 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.61 
 
 		 502 aa  203  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 536 aa  203  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  31.53 
 
 		 602 aa  202  9e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>