More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0938 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  62.61 
 
 		 573 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  65.85 
 
 		 578 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  61.86 
 
 		 579 aa  667    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.63 
 
 		 587 aa  641    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  65.84 
 
 		 567 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  66.08 
 
 		 605 aa  700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  64.3 
 
 		 574 aa  675    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  62.98 
 
 		 569 aa  672    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 595 aa  1166    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  64.42 
 
 		 574 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  83.42 
 
 		 593 aa  873    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  68.86 
 
 		 552 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  60.73 
 
 		 582 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  61.35 
 
 		 572 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  65.67 
 
 		 577 aa  722    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  62.59 
 
 		 583 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  62.05 
 
 		 579 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 		 600 aa  670    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  62.24 
 
 		 579 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  62.26 
 
 		 584 aa  645    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  64.25 
 
 		 568 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  62.85 
 
 		 573 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  61.78 
 
 		 585 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  62.74 
 
 		 639 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 		 603 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.08 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  63.46 
 
 		 575 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  61.71 
 
 		 579 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  61.52 
 
 		 579 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  61.52 
 
 		 579 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  62.55 
 
 		 576 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  61.8 
 
 		 585 aa  598  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  58.82 
 
 		 582 aa  594  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  61.76 
 
 		 581 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  57.25 
 
 		 603 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.82 
 
 		 585 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  54.4 
 
 		 582 aa  548  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  55.39 
 
 		 582 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 		 582 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  52.96 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.48 
 
 		 583 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  46.78 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 		 581 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  48.83 
 
 		 583 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 546 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 516 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  39.93 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.6 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.67 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 531 aa  296  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.58 
 
 		 525 aa  293  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.82 
 
 		 537 aa  293  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 542 aa  293  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 566 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.94 
 
 		 530 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 552 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 543 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 		 532 aa  281  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 534 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 		 532 aa  279  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.46 
 
 		 560 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 543 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 543 aa  273  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  34.23 
 
 		 700 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 		 524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 		 533 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 519 aa  269  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.68 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.51 
 
 		 522 aa  267  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.59 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 564 aa  267  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 536 aa  267  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 528 aa  267  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 518 aa  264  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 519 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 556 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 519 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 520 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 559 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 559 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 576 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 540 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.2 
 
 		 517 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 554 aa  246  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.63 
 
 		 560 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.63 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.63 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.63 
 
 		 560 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>