More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1921 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
524 aa  1057    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  52.36 
 
 
519 aa  501  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 
525 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  52.37 
 
 
529 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 
516 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.34 
 
 
530 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  56 
 
 
543 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 
534 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  52.01 
 
 
518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 
546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  51.19 
 
 
533 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 
532 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 
525 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  48.17 
 
 
536 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  50.39 
 
 
532 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  51.83 
 
 
517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  49.71 
 
 
519 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  50.4 
 
 
528 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  48.63 
 
 
519 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  51.68 
 
 
540 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  52.52 
 
 
520 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  40.31 
 
 
520 aa  386  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  45.27 
 
 
546 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
542 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  41.98 
 
 
545 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
539 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 
531 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.71 
 
 
532 aa  346  5e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
537 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 
537 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  34.97 
 
 
700 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
548 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 
552 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  39.36 
 
 
602 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
543 aa  309  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 
603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.92 
 
 
585 aa  300  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  37.96 
 
 
798 aa  300  5e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.48 
 
 
591 aa  300  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
582 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35 
 
 
640 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 
574 aa  290  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  36.62 
 
 
668 aa  289  9e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
582 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
568 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
582 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  39.93 
 
 
603 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
573 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 
569 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.32 
 
 
605 aa  276  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  40.83 
 
 
600 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.87 
 
 
583 aa  273  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  41.4 
 
 
639 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 
582 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 
573 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.81 
 
 
567 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 
577 aa  270  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 
579 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
559 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  39.59 
 
 
595 aa  266  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
560 aa  266  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
554 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
578 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  42.97 
 
 
585 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
567 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
579 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
584 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
559 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
585 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 
579 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 
579 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  42.29 
 
 
579 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  39.6 
 
 
574 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
572 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.12 
 
 
583 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.42 
 
 
559 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 
575 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
582 aa  256  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
562 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 
552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  43.18 
 
 
576 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.33 
 
 
522 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.33 
 
 
587 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.96 
 
 
554 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
519 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  35.69 
 
 
525 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
564 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
581 aa  247  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
559 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
557 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 
557 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
581 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
517 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  39.64 
 
 
520 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
529 aa  239  9e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  40.73 
 
 
511 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
556 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>