More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0569 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
536 aa  1089    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  61.28 
 
 
530 aa  632  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.02 
 
 
525 aa  610  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  56.62 
 
 
525 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  52.03 
 
 
516 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  52.9 
 
 
518 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  52.64 
 
 
519 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 
519 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  51.16 
 
 
519 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  52.13 
 
 
517 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  49.42 
 
 
543 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  48.17 
 
 
524 aa  464  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 
546 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  48.59 
 
 
534 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  48.01 
 
 
529 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  48.01 
 
 
528 aa  452  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  46 
 
 
566 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  47.84 
 
 
533 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  49.23 
 
 
540 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  47.72 
 
 
532 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 
532 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 
542 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  40.77 
 
 
545 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  41.14 
 
 
520 aa  397  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  40.59 
 
 
546 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
537 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
537 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.39 
 
 
531 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.92 
 
 
532 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  43.49 
 
 
520 aa  363  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  40.07 
 
 
539 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  40.37 
 
 
602 aa  345  1e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
552 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 
543 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  36.25 
 
 
700 aa  335  1e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
548 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.94 
 
 
640 aa  326  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  37.35 
 
 
668 aa  309  8e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  38.64 
 
 
798 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 
569 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
591 aa  292  9e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 
573 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 
574 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
583 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
579 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
584 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
582 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.96 
 
 
585 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
577 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 
572 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
579 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 
568 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
579 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
600 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
605 aa  276  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
582 aa  274  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
557 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 
583 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
603 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
603 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
581 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 
575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 
573 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 
639 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
593 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
552 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  34.38 
 
 
585 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
574 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
582 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 
556 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 
562 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.59 
 
 
567 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.52 
 
 
554 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 
576 aa  260  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
579 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
579 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.78 
 
 
587 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
579 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
595 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.7 
 
 
557 aa  257  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.27 
 
 
583 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
578 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
582 aa  254  3e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
581 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.24 
 
 
529 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.06 
 
 
573 aa  253  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  33.78 
 
 
559 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.06 
 
 
557 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
559 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
567 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
567 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
543 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 
555 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 
585 aa  247  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
559 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  34.96 
 
 
525 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 
554 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.65 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
582 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
559 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>