More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4361 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  60.79 
 
 
560 aa  635    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  61.8 
 
 
559 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
557 aa  1101    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  60.22 
 
 
559 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  59.1 
 
 
559 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  59.1 
 
 
559 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 
573 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 
569 aa  330  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  41.42 
 
 
600 aa  329  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
576 aa  316  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 
582 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  41.21 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  39.93 
 
 
577 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
579 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
579 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
579 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.58 
 
 
554 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
583 aa  306  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
516 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
568 aa  306  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1035  FAD dependent oxidoreductase  42.98 
 
 
556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 
574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.24 
 
 
591 aa  303  7.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 
595 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 
581 aa  301  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.77 
 
 
587 aa  300  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.56 
 
 
525 aa  299  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  39.31 
 
 
579 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
639 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  41.21 
 
 
574 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  40.3 
 
 
585 aa  297  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
572 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 
603 aa  296  8e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 
585 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
578 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
552 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.6 
 
 
567 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.37 
 
 
585 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  40.12 
 
 
603 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
575 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 
543 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 
552 aa  289  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  40.31 
 
 
593 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
582 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.49 
 
 
605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
582 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  39.64 
 
 
584 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 
537 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.92 
 
 
532 aa  279  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
543 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 
537 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 
567 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 
539 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  39.11 
 
 
582 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 
519 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
525 aa  272  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
536 aa  269  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 
534 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 
519 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 
583 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
518 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
519 aa  266  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 
582 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
530 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 
543 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.54 
 
 
583 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
531 aa  264  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 
546 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 
562 aa  260  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  37.5 
 
 
545 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.48 
 
 
522 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 
528 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 
529 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 
519 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 
546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 
532 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 
548 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 
517 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
533 aa  253  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 
538 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
567 aa  250  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  36.72 
 
 
524 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 
566 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  39.12 
 
 
516 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  29.25 
 
 
520 aa  247  4.9999999999999997e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  38.29 
 
 
517 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  35.77 
 
 
602 aa  246  9e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
542 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  40.17 
 
 
516 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  32.51 
 
 
700 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 
540 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
556 aa  233  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
581 aa  233  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
546 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.14 
 
 
502 aa  230  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
564 aa  229  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>