More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0487 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  71.18 
 
 
582 aa  797    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  67.3 
 
 
582 aa  754    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  67.08 
 
 
603 aa  760    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  71.7 
 
 
585 aa  838    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
582 aa  1182    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  56.12 
 
 
568 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  54.28 
 
 
583 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.13 
 
 
591 aa  579  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  53.93 
 
 
579 aa  581  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  51.73 
 
 
574 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 
574 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.6 
 
 
605 aa  558  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.78 
 
 
583 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.97 
 
 
554 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
578 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  51.65 
 
 
600 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  52.45 
 
 
579 aa  529  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  51.57 
 
 
573 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  51.68 
 
 
552 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  50.08 
 
 
584 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  52.3 
 
 
573 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  49.74 
 
 
577 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  50.35 
 
 
569 aa  516  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.79 
 
 
567 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  51.79 
 
 
595 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  47.99 
 
 
572 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  51.68 
 
 
575 aa  506  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  48.96 
 
 
579 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 
582 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  49.32 
 
 
639 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  50.18 
 
 
603 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.91 
 
 
587 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 
576 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 
579 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 
579 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 
579 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  48.55 
 
 
593 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  50.19 
 
 
585 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  46.92 
 
 
582 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  48.86 
 
 
585 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  49.19 
 
 
581 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 
567 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  42.97 
 
 
562 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 
581 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 
583 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 
546 aa  316  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
539 aa  306  6e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 
525 aa  296  5e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
524 aa  293  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
542 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  36.5 
 
 
545 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 
537 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 
531 aa  288  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 
529 aa  287  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
566 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 
516 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 
557 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  32.54 
 
 
700 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
537 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
525 aa  280  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 
534 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 
519 aa  276  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 
543 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
530 aa  273  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.26 
 
 
532 aa  273  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
567 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 
532 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 
532 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
546 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
548 aa  266  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
519 aa  264  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  33.89 
 
 
559 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 
559 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  37.17 
 
 
798 aa  262  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
528 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
543 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  35.11 
 
 
602 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
560 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
519 aa  256  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
536 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
543 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
533 aa  252  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
559 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
556 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 
576 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 
668 aa  244  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 
518 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 
554 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 
559 aa  241  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
540 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  34.34 
 
 
517 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.31 
 
 
522 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
520 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
564 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
527 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.02 
 
 
640 aa  239  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1035  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
556 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 
516 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
529 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>