More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6411 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  63.8 
 
 		 593 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  60.35 
 
 		 579 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.25 
 
 		 567 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  73.05 
 
 		 576 aa  760    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 579 aa  1152    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.91 
 
 		 605 aa  663    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  75.44 
 
 		 579 aa  840    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  68.09 
 
 		 575 aa  702    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  71.97 
 
 		 581 aa  768    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  62.05 
 
 		 595 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  65.47 
 
 		 569 aa  709    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  62.45 
 
 		 552 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  61.39 
 
 		 568 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  71.95 
 
 		 582 aa  823    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  74.11 
 
 		 579 aa  791    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 600 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  62.83 
 
 		 578 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  82.58 
 
 		 587 aa  911    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  73.94 
 
 		 579 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  59.65 
 
 		 583 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 577 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  72.34 
 
 		 585 aa  788    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  74.11 
 
 		 579 aa  791    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  71.75 
 
 		 585 aa  764    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  59.29 
 
 		 574 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  61.16 
 
 		 574 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  58.48 
 
 		 573 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.32 
 
 		 554 aa  599  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  56.51 
 
 		 572 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  59.07 
 
 		 584 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  58.63 
 
 		 603 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  58.57 
 
 		 639 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  57.01 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  54.3 
 
 		 582 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  53.72 
 
 		 603 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  52.87 
 
 		 582 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.08 
 
 		 585 aa  545  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  51.94 
 
 		 567 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  48.96 
 
 		 582 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.05 
 
 		 583 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.02 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  49.91 
 
 		 582 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  46.11 
 
 		 562 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  45.66 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  47.13 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  39.7 
 
 		 539 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 557 aa  311  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.52 
 
 		 532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 525 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 		 537 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 516 aa  299  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  40.07 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 566 aa  296  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  38.38 
 
 		 559 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 543 aa  296  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  36.7 
 
 		 545 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 529 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.64 
 
 		 530 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 537 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 543 aa  290  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  39.05 
 
 		 532 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.84 
 
 		 532 aa  287  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 552 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.68 
 
 		 525 aa  286  9e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 536 aa  277  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 548 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  39.42 
 
 		 559 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.57 
 
 		 700 aa  273  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.11 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 546 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 556 aa  271  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 564 aa  270  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 528 aa  270  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 		 533 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 519 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 554 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 524 aa  263  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 		 573 aa  262  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 		 557 aa  262  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  37.14 
 
 		 602 aa  260  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  31.95 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 519 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 546 aa  256  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 567 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  33.78 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  35.3 
 
 		 557 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.63 
 
 		 522 aa  250  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 560 aa  247  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>