More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2873 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  67.76 
 
 		 552 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  61.74 
 
 		 554 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  66.02 
 
 		 578 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  65.43 
 
 		 605 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  64.02 
 
 		 577 aa  721    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  59.01 
 
 		 600 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  60.32 
 
 		 573 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  60.81 
 
 		 595 aa  639    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  59.79 
 
 		 579 aa  652    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  67.14 
 
 		 568 aa  752    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  92.99 
 
 		 579 aa  1060    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  66.29 
 
 		 569 aa  708    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  64.34 
 
 		 574 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  63.8 
 
 		 567 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  63.46 
 
 		 574 aa  741    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 583 aa  1179    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  60.14 
 
 		 584 aa  658    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 593 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  59.15 
 
 		 579 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 		 572 aa  631  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.82 
 
 		 587 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  58.76 
 
 		 582 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  61.09 
 
 		 576 aa  605  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  56.06 
 
 		 573 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  54.42 
 
 		 603 aa  598  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  55.5 
 
 		 585 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  58.69 
 
 		 579 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  58.69 
 
 		 579 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  55.94 
 
 		 603 aa  591  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  55.17 
 
 		 582 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  58.49 
 
 		 579 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53 
 
 		 585 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  55.59 
 
 		 639 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  54.28 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  59 
 
 		 585 aa  578  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  57.5 
 
 		 575 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  58.98 
 
 		 581 aa  571  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  54.8 
 
 		 582 aa  571  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.62 
 
 		 591 aa  512  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.11 
 
 		 583 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 		 567 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 562 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  48.55 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 546 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.52 
 
 		 545 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 542 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 552 aa  307  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 557 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 534 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 539 aa  303  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 543 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 516 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.95 
 
 		 532 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.55 
 
 		 530 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.14 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 537 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.43 
 
 		 559 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 536 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 532 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 532 aa  283  9e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  35.12 
 
 		 700 aa  280  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  38.02 
 
 		 602 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 566 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  36.48 
 
 		 559 aa  278  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.98 
 
 		 543 aa  277  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 524 aa  276  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 559 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 548 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 519 aa  269  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.65 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 540 aa  256  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  34.48 
 
 		 798 aa  253  6e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  31.17 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 520 aa  252  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 567 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 668 aa  249  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  36.58 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 543 aa  243  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 576 aa  240  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.68 
 
 		 557 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 564 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>