More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2412 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
552 aa  1090    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  80 
 
 
551 aa  794    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  47.72 
 
 
543 aa  466  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  49.51 
 
 
536 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  48.59 
 
 
556 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 
550 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 
545 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
547 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 
566 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
576 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  39.27 
 
 
574 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 
567 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.38 
 
 
591 aa  251  3e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
595 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
545 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  33.96 
 
 
545 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
546 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 
525 aa  248  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
525 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 
542 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.79 
 
 
567 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
519 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
546 aa  243  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
562 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.79 
 
 
593 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 
581 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
600 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
578 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
574 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.45 
 
 
510 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
537 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.14 
 
 
605 aa  238  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
518 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
572 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
577 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.59 
 
 
585 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.87 
 
 
554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.77 
 
 
582 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
519 aa  234  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.91 
 
 
583 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
584 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
573 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
539 aa  233  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
529 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
536 aa  233  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 
516 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
579 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 
603 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
568 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
583 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 
639 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.83 
 
 
514 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
582 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
579 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.19 
 
 
557 aa  229  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
582 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.19 
 
 
573 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
579 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.68 
 
 
557 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
569 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
527 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
552 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  35.1 
 
 
517 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.15 
 
 
587 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
571 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
587 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 
582 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
537 aa  225  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.7 
 
 
514 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.59 
 
 
503 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
603 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
557 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 
564 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
582 aa  223  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 
573 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 
575 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
500 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.53 
 
 
530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.49 
 
 
503 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.85 
 
 
495 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2990  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.78 
 
 
524 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.35 
 
 
502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
582 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
557 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
517 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.9 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 
502 aa  219  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
507 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.41 
 
 
514 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
519 aa  219  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
562 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
511 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.22 
 
 
502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  36.06 
 
 
585 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.99 
 
 
513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
576 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.57 
 
 
513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
531 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>