More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0728 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
530 aa  1080    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  61.28 
 
 
536 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.38 
 
 
525 aa  615  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  55.19 
 
 
516 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  56.79 
 
 
525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  55.38 
 
 
518 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 
519 aa  541  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  51.64 
 
 
519 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  56.73 
 
 
517 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 
519 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  53.48 
 
 
543 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  54.34 
 
 
524 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  50.78 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 
566 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  50.78 
 
 
546 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  51.26 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 
532 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  49.32 
 
 
529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  50.39 
 
 
540 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  47.17 
 
 
528 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  42.47 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  45.18 
 
 
542 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  42.8 
 
 
545 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
539 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 
546 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
537 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 
537 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  44.15 
 
 
548 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
531 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.18 
 
 
532 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
543 aa  360  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  38.41 
 
 
700 aa  359  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  44.33 
 
 
520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.26 
 
 
640 aa  345  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 
552 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  42.58 
 
 
602 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  39.66 
 
 
798 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  39.03 
 
 
668 aa  322  7e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 
574 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
579 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  35.81 
 
 
525 aa  290  5.0000000000000004e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
583 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
569 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 
579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.47 
 
 
591 aa  286  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.62 
 
 
605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 
573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  36.86 
 
 
579 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 
575 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
600 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
584 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.21 
 
 
585 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
582 aa  279  9e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 
581 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.03 
 
 
529 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 
568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.22 
 
 
582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  35.11 
 
 
585 aa  274  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  37.92 
 
 
552 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
639 aa  273  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 
603 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.57 
 
 
559 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.33 
 
 
554 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
562 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.47 
 
 
587 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 
582 aa  270  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
579 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
595 aa  269  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34 
 
 
557 aa  269  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
573 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.91 
 
 
557 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
577 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 
603 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
579 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
572 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 
559 aa  266  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
573 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
576 aa  263  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 
574 aa  263  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
581 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.4 
 
 
567 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
559 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
508 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 
560 aa  259  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
557 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 
593 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
578 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  35.52 
 
 
560 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
519 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
582 aa  256  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
560 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  35.2 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  35.2 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.2 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  35.2 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
585 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>