More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4065 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
567 aa  1123    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  52.36 
 
 
574 aa  529  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  53.25 
 
 
600 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 
579 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  50.36 
 
 
572 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  53.02 
 
 
573 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 
569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.55 
 
 
605 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  50.44 
 
 
568 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
574 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  53.39 
 
 
595 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  50.27 
 
 
577 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.88 
 
 
587 aa  505  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  50.18 
 
 
578 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  50.1 
 
 
562 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  51.18 
 
 
584 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  52.34 
 
 
573 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  51.08 
 
 
593 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 
581 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.55 
 
 
567 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  48.42 
 
 
579 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  51.19 
 
 
552 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.97 
 
 
554 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  51.64 
 
 
603 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  47.12 
 
 
583 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  48.66 
 
 
582 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  50.56 
 
 
575 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 
579 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  50.09 
 
 
576 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  49.23 
 
 
582 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  49.82 
 
 
585 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  48.9 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  48.9 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 
603 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 
579 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.13 
 
 
585 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
582 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 
639 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  49.81 
 
 
581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  48.37 
 
 
582 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  49.44 
 
 
585 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 
582 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.34 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.38 
 
 
591 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 
583 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
516 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
546 aa  297  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 
560 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 
534 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  37.93 
 
 
545 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 
539 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 
537 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 
518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 
537 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 
557 aa  279  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 
519 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 
543 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 
559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
531 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.94 
 
 
532 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.08 
 
 
525 aa  271  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  38.83 
 
 
517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 
524 aa  270  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
532 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
532 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.77 
 
 
530 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
519 aa  263  6e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
546 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 
566 aa  263  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.93 
 
 
559 aa  261  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
525 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 
533 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
528 aa  258  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
519 aa  255  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 
540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
543 aa  253  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
536 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.97 
 
 
522 aa  250  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
559 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
548 aa  249  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
547 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  38.61 
 
 
559 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
556 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
520 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  39.85 
 
 
538 aa  241  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
550 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  30.16 
 
 
700 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  29.74 
 
 
520 aa  232  1e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
543 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
536 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
520 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
552 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  32.18 
 
 
543 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 
546 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1035  FAD dependent oxidoreductase  36.95 
 
 
556 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.16 
 
 
502 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
576 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.74 
 
 
502 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>