More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3670 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 566 aa  1147    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  72.54 
 
 		 533 aa  732    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  72.13 
 
 		 532 aa  708    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  70.62 
 
 		 529 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  69.53 
 
 		 540 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  68.41 
 
 		 528 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  71.99 
 
 		 532 aa  708    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  52.87 
 
 		 534 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  52.49 
 
 		 546 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.99 
 
 		 525 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  47.64 
 
 		 519 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 516 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.95 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 		 524 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  43.02 
 
 		 525 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  49.29 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  46 
 
 		 536 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  48.41 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  49.71 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 546 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  39.35 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  40.93 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  41.24 
 
 		 539 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 		 542 aa  349  7e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.57 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 537 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  39.85 
 
 		 537 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  40.4 
 
 		 602 aa  329  9e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 531 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  39.69 
 
 		 552 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.84 
 
 		 640 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 548 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  38.37 
 
 		 798 aa  307  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  34.36 
 
 		 700 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 		 668 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 543 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 579 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 573 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.31 
 
 		 585 aa  274  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.33 
 
 		 591 aa  273  6e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 569 aa  270  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.74 
 
 		 605 aa  270  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  36.4 
 
 		 585 aa  266  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 578 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  38.34 
 
 		 603 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  38.31 
 
 		 639 aa  264  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 575 aa  263  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 579 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 579 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 		 579 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 583 aa  261  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 		 574 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 577 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 600 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  35.88 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.92 
 
 		 587 aa  258  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.03 
 
 		 567 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 579 aa  256  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 576 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 581 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 568 aa  253  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  36.84 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 546 aa  252  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 564 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.54 
 
 		 557 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 585 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 559 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.54 
 
 		 573 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  37.5 
 
 		 543 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 552 aa  247  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.97 
 
 		 554 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.9 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 520 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  36.76 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.13 
 
 		 559 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.32 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 567 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 560 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.67 
 
 		 522 aa  240  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.73 
 
 		 583 aa  239  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 559 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  37.93 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 554 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>