More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3637 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  64.86 
 
 		 567 aa  670    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  66.61 
 
 		 605 aa  708    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  66.55 
 
 		 552 aa  665    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  63.68 
 
 		 577 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  60.1 
 
 		 579 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 569 aa  667    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  61.59 
 
 		 600 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  63.97 
 
 		 574 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  62.24 
 
 		 568 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  62.07 
 
 		 574 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  60.14 
 
 		 583 aa  658    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  64.19 
 
 		 573 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 584 aa  1148    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  65.63 
 
 		 578 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  62.26 
 
 		 595 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  61.47 
 
 		 593 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  56.75 
 
 		 572 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  60.75 
 
 		 575 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.8 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  58.38 
 
 		 579 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  59.14 
 
 		 579 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  57.07 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.66 
 
 		 587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  54.39 
 
 		 603 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  57.94 
 
 		 582 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.71 
 
 		 585 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  52.3 
 
 		 582 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 639 aa  545  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  56.27 
 
 		 579 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  56.08 
 
 		 579 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  56.27 
 
 		 579 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  53.61 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  55.22 
 
 		 585 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  53.52 
 
 		 582 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  57.55 
 
 		 585 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 582 aa  529  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  55.98 
 
 		 576 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  56.65 
 
 		 581 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.09 
 
 		 591 aa  500  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  50.84 
 
 		 567 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.9 
 
 		 583 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  45.89 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 		 583 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  39.23 
 
 		 545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.36 
 
 		 525 aa  303  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 546 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 542 aa  297  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 539 aa  296  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 543 aa  294  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.64 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  36.41 
 
 		 536 aa  283  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 537 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 566 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 519 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 560 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.11 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 543 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 519 aa  269  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 524 aa  266  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 559 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 532 aa  266  8e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 534 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  37.09 
 
 		 533 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 532 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 531 aa  264  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 559 aa  263  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.17 
 
 		 559 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 528 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.04 
 
 		 522 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.79 
 
 		 529 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 550 aa  253  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 567 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.04 
 
 		 700 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  40.04 
 
 		 538 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 543 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.79 
 
 		 517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 540 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.97 
 
 		 560 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.97 
 
 		 560 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.97 
 
 		 560 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.97 
 
 		 560 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.97 
 
 		 560 aa  242  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.23 
 
 		 602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  32.78 
 
 		 543 aa  240  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  33.78 
 
 		 560 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.78 
 
 		 560 aa  239  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>