More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1671 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 576 aa  1174    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  38.87 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 556 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 545 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 603 aa  263  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 578 aa  250  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 546 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 536 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.32 
 
 		 554 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.8 
 
 		 530 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 639 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.61 
 
 		 591 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.1 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.12 
 
 		 567 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 555 aa  241  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 		 603 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 522 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 539 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 525 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  32.32 
 
 		 700 aa  236  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.02 
 
 		 605 aa  236  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 577 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.16 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 576 aa  234  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 		 668 aa  233  8.000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 		 573 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 569 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 537 aa  230  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 537 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 531 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.16 
 
 		 545 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  33.98 
 
 		 798 aa  229  9e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.23 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 552 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 584 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.57 
 
 		 532 aa  227  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 		 551 aa  227  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 579 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 595 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  34.5 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.31 
 
 		 585 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 		 585 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.52 
 
 		 581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 579 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 579 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 579 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 583 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.19 
 
 		 557 aa  221  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.19 
 
 		 573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 582 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 593 aa  221  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 566 aa  220  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  34.81 
 
 		 585 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 579 aa  217  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.95 
 
 		 502 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.51 
 
 		 557 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 		 546 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 543 aa  213  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 554 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.63 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.43 
 
 		 502 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 560 aa  210  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 560 aa  210  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 548 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.08 
 
 		 560 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.91 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.91 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 534 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.91 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 519 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 536 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.37 
 
 		 560 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 542 aa  207  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 575 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 518 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 519 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.73 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.73 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  30.55 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>