More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2214 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
534 aa  1068    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  83.86 
 
 
546 aa  889    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  57.31 
 
 
516 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  57.47 
 
 
519 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
529 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  54.56 
 
 
518 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  52.87 
 
 
566 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.88 
 
 
525 aa  499  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  48.67 
 
 
525 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  54.38 
 
 
533 aa  495  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  54.25 
 
 
528 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 
532 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  55.41 
 
 
532 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 
524 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.78 
 
 
530 aa  472  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  54.48 
 
 
517 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  49.72 
 
 
519 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  49.24 
 
 
519 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 
540 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  48.59 
 
 
536 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  51.42 
 
 
543 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  40.61 
 
 
520 aa  430  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  41.64 
 
 
546 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
531 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  42.86 
 
 
545 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  42.57 
 
 
539 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  42.24 
 
 
537 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  41.2 
 
 
602 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
542 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 
537 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.83 
 
 
532 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
520 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  36.95 
 
 
700 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 
548 aa  329  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 
543 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.59 
 
 
640 aa  306  7e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 
603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
583 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  37.55 
 
 
798 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  38.63 
 
 
668 aa  300  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
591 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 
579 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  40.22 
 
 
575 aa  292  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  41.68 
 
 
639 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
582 aa  289  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 
569 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  39.78 
 
 
600 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 
573 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
579 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 
573 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 
578 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
574 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
567 aa  279  8e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.43 
 
 
585 aa  279  9e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 
576 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
603 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 
582 aa  277  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 
568 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  38.82 
 
 
577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
595 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 
582 aa  273  8.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.48 
 
 
567 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
579 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
582 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.46 
 
 
554 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.07 
 
 
583 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
582 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
579 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
579 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  38.26 
 
 
585 aa  270  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.54 
 
 
605 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.67 
 
 
559 aa  266  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  41.44 
 
 
583 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.7 
 
 
587 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
584 aa  263  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
581 aa  263  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
572 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 
593 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  38.56 
 
 
559 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 
581 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
559 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 
585 aa  256  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 
557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.09 
 
 
559 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  36.72 
 
 
525 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 
560 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
574 aa  251  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.26 
 
 
529 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.33 
 
 
554 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
546 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  32.16 
 
 
543 aa  244  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 
552 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  35.74 
 
 
562 aa  240  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
573 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
557 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.15 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.09 
 
 
560 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>