More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  62.48 
 
 		 579 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  63.49 
 
 		 569 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  66.24 
 
 		 552 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.64 
 
 		 605 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  63.12 
 
 		 578 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  63.64 
 
 		 574 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  64.33 
 
 		 574 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  64.95 
 
 		 568 aa  675    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  62.39 
 
 		 577 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  61.74 
 
 		 583 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 554 aa  1095    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  62.48 
 
 		 600 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  62.92 
 
 		 567 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  63.4 
 
 		 573 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  60.83 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  58.29 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  61.82 
 
 		 595 aa  598  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  59.82 
 
 		 579 aa  601  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  58.8 
 
 		 584 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  60.41 
 
 		 593 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  59.25 
 
 		 579 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  57.75 
 
 		 582 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 		 582 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  60.59 
 
 		 587 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  57.92 
 
 		 603 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.96 
 
 		 585 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  59.85 
 
 		 576 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  59.41 
 
 		 575 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  57.99 
 
 		 579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  56.51 
 
 		 603 aa  557  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  57.25 
 
 		 585 aa  555  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  56.33 
 
 		 582 aa  558  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  55.45 
 
 		 582 aa  551  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  56.15 
 
 		 639 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  58.27 
 
 		 585 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  54.58 
 
 		 582 aa  544  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  57.79 
 
 		 581 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.81 
 
 		 591 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.21 
 
 		 583 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  50.75 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  48.44 
 
 		 562 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 581 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  49.35 
 
 		 583 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 546 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 557 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.64 
 
 		 545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 		 542 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 531 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.15 
 
 		 559 aa  296  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.35 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 560 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 		 543 aa  287  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 		 559 aa  287  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 		 552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.89 
 
 		 530 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 567 aa  276  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 		 534 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 537 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 537 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 		 543 aa  267  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.31 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 546 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 576 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 519 aa  263  8e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 566 aa  260  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.73 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 529 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  33.39 
 
 		 700 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 564 aa  253  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 548 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 524 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 543 aa  250  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.51 
 
 		 602 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 		 532 aa  247  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 554 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 533 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  40.87 
 
 		 538 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 519 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 557 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.99 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  35.84 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 546 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.25 
 
 		 560 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>