More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3375 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 537 aa  1084    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  90.6 
 
 		 537 aa  987    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  56.98 
 
 		 539 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  56.45 
 
 		 548 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 531 aa  542  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.34 
 
 		 532 aa  528  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  52.48 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  51.5 
 
 		 542 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 		 546 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  41.64 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  43.84 
 
 		 798 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  45.63 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  42.88 
 
 		 668 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  45.51 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 		 543 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.51 
 
 		 640 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.69 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  42.61 
 
 		 518 aa  359  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 		 519 aa  359  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.08 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 536 aa  356  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  43.37 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  42.24 
 
 		 534 aa  349  7e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  41.35 
 
 		 519 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 529 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 525 aa  342  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  43.58 
 
 		 543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 		 528 aa  337  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 566 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 546 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  41.68 
 
 		 533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  38.83 
 
 		 562 aa  327  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 		 524 aa  323  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 532 aa  316  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.11 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  34.25 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 		 600 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 540 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  38.4 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.34 
 
 		 591 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  38.2 
 
 		 579 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 603 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 583 aa  279  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  39.93 
 
 		 573 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 639 aa  278  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.1 
 
 		 567 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 569 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.14 
 
 		 585 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 595 aa  272  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.46 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.26 
 
 		 605 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 568 aa  270  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 603 aa  269  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 579 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 582 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 		 562 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 567 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.17 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 584 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 573 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 556 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 552 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 575 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 557 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  37.48 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 557 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 		 557 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.35 
 
 		 554 aa  253  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 		 573 aa  253  7e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  37.55 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 555 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  35.67 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 559 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 583 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 522 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 		 582 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  32.58 
 
 		 543 aa  246  8e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 581 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.89 
 
 		 557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 585 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>