More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2018 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 581 aa  1146    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 		 562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 		 567 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  47.24 
 
 		 574 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 		 579 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 568 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  45.66 
 
 		 569 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.78 
 
 		 554 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 574 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.68 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  45.57 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  45.66 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  44.25 
 
 		 582 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 583 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  44.4 
 
 		 579 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 		 595 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  45.6 
 
 		 573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.42 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 584 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 		 573 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  44.49 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 		 576 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.78 
 
 		 587 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 600 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.59 
 
 		 591 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  46.02 
 
 		 552 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  45.02 
 
 		 603 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.59 
 
 		 605 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.14 
 
 		 583 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 		 579 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 579 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 579 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 		 582 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  45.8 
 
 		 593 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  45.02 
 
 		 639 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  43.65 
 
 		 585 aa  385  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 		 575 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 581 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 		 582 aa  363  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 		 585 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 		 583 aa  306  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.14 
 
 		 530 aa  287  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 566 aa  286  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 537 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.64 
 
 		 525 aa  277  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 532 aa  276  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 532 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 543 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  35.84 
 
 		 545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  37.18 
 
 		 519 aa  270  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 		 537 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 529 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 		 531 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 536 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 519 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  39 
 
 		 517 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 		 519 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 525 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  38.31 
 
 		 602 aa  263  4.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.2 
 
 		 543 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 528 aa  263  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 542 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 548 aa  251  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 546 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.39 
 
 		 522 aa  243  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  32.79 
 
 		 700 aa  242  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.05 
 
 		 532 aa  240  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 540 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  33.9 
 
 		 798 aa  233  6e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.8 
 
 		 502 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 668 aa  233  9e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 560 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  32.98 
 
 		 559 aa  230  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 		 559 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 559 aa  222  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  29.87 
 
 		 520 aa  220  5e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  36.78 
 
 		 520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 567 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 547 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.41 
 
 		 551 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>