More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1419 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  99.63 
 
 
545 aa  1080    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  97.43 
 
 
545 aa  1011    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  82.54 
 
 
545 aa  855    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
545 aa  1082    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  36.71 
 
 
556 aa  257  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  36.17 
 
 
556 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.27 
 
 
547 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.64 
 
 
552 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.58 
 
 
551 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.54 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.71 
 
 
547 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.21 
 
 
551 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.27 
 
 
547 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.9 
 
 
542 aa  239  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.7 
 
 
542 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.7 
 
 
542 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.7 
 
 
542 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.7 
 
 
542 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.7 
 
 
542 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
545 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  34.59 
 
 
552 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  33.71 
 
 
542 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  32.61 
 
 
562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  33.15 
 
 
556 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  33.94 
 
 
585 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  30.92 
 
 
560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
543 aa  217  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  32.6 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
514 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  33.84 
 
 
545 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
547 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.74 
 
 
551 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  32.1 
 
 
572 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
552 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 
567 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
559 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.38 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.85 
 
 
567 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  32.38 
 
 
582 aa  198  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
574 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
556 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
536 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
550 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 
593 aa  190  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
582 aa  189  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
542 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.58 
 
 
591 aa  188  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  31 
 
 
535 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
578 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
582 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
639 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
569 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  28.57 
 
 
556 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
581 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33 
 
 
605 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 
577 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
574 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  33.84 
 
 
595 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
576 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
552 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
579 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
579 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
579 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
579 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
600 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
537 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.52 
 
 
587 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.53 
 
 
583 aa  173  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
552 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
557 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
579 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.24 
 
 
585 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
509 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.66 
 
 
532 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
522 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
585 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
576 aa  170  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28 
 
 
530 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
543 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
572 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
525 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
584 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
384 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  32.23 
 
 
585 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>