More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0933 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  100 
 
 
556 aa  1138    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  89.03 
 
 
556 aa  1026    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  72.79 
 
 
572 aa  841    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  73.83 
 
 
582 aa  826    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  70.81 
 
 
585 aa  830    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 
559 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  43.27 
 
 
533 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.32 
 
 
552 aa  388  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 
556 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  43.71 
 
 
556 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.22 
 
 
535 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  40.63 
 
 
514 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.21 
 
 
551 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.21 
 
 
551 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.47 
 
 
547 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.92 
 
 
560 aa  365  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.13 
 
 
547 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.17 
 
 
542 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.78 
 
 
542 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.04 
 
 
547 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.01 
 
 
556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
407 aa  353  5e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.96 
 
 
552 aa  353  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.97 
 
 
542 aa  352  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.64 
 
 
556 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  38.4 
 
 
562 aa  346  7e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
539 aa  333  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
522 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.02 
 
 
512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 
516 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  48.09 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  47.33 
 
 
408 aa  303  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
445 aa  293  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 
389 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  39.54 
 
 
435 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  40.32 
 
 
384 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
486 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
392 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
432 aa  230  6e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
545 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
545 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
545 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
547 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 
556 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
543 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
537 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
562 aa  127  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
496 aa  127  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
500 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 
548 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
537 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
581 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 
552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
542 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.06 
 
 
507 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 
551 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.14 
 
 
495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.46 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
478 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.21 
 
 
502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
543 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.37 
 
 
495 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
574 aa  114  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.35 
 
 
500 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.57 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.53 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.21 
 
 
502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.36 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
603 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.05 
 
 
529 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 
519 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.67 
 
 
516 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.13 
 
 
514 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 
529 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
559 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
532 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.13 
 
 
503 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.06 
 
 
509 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.83 
 
 
530 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.19 
 
 
514 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.54 
 
 
557 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
532 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>