More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1799 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  866    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  50.61 
 
 
445 aa  386  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 
435 aa  369  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  37.63 
 
 
552 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 
516 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  38.38 
 
 
535 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  38.3 
 
 
556 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 
559 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
533 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  37.06 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.62 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.62 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.62 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.62 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.62 
 
 
542 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.62 
 
 
542 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  37.36 
 
 
551 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  36.18 
 
 
552 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  37.5 
 
 
512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 
556 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  35.38 
 
 
556 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  37.36 
 
 
551 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.58 
 
 
556 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
539 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  35.07 
 
 
542 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  35.12 
 
 
556 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.12 
 
 
556 aa  236  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  34.53 
 
 
542 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  34.15 
 
 
585 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  34.25 
 
 
560 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.71 
 
 
547 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  33.88 
 
 
572 aa  232  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 
514 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  36.27 
 
 
582 aa  229  9e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  34.25 
 
 
547 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
407 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
389 aa  223  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  35.16 
 
 
562 aa  213  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
424 aa  190  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
576 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
545 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
545 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 
551 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
556 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  26.88 
 
 
559 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
562 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
573 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
574 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
559 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
559 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
546 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
595 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
582 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
552 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
543 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 
539 aa  98.2  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
525 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 
543 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.33 
 
 
557 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
511 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
516 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
566 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 
566 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
573 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
536 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.87 
 
 
525 aa  93.6  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.11 
 
 
585 aa  93.6  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.64 
 
 
503 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 
593 aa  93.6  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 
542 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 
552 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.08 
 
 
503 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.24 
 
 
567 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
534 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
537 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
529 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
537 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 
574 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.08 
 
 
514 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
547 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
546 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
560 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  22.62 
 
 
506 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
559 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>