More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1127 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
384 aa  768    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 
392 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 
389 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  43.73 
 
 
445 aa  309  5e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  42.9 
 
 
533 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
559 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  44.23 
 
 
512 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
435 aa  293  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  40.85 
 
 
552 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 
539 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  43.53 
 
 
542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  43.21 
 
 
542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
516 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.55 
 
 
551 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.98 
 
 
542 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.42 
 
 
542 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.42 
 
 
542 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.27 
 
 
551 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.42 
 
 
542 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.42 
 
 
542 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.42 
 
 
542 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
556 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  41.87 
 
 
547 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.09 
 
 
556 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.13 
 
 
572 aa  275  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  43.39 
 
 
547 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.21 
 
 
556 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  43.39 
 
 
556 aa  272  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  43.65 
 
 
556 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41.51 
 
 
556 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  42.7 
 
 
552 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 
514 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  41 
 
 
535 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  43.39 
 
 
407 aa  266  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.69 
 
 
585 aa  262  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 
522 aa  262  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.67 
 
 
547 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  38.66 
 
 
560 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  39.89 
 
 
562 aa  249  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  39.25 
 
 
582 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  40.21 
 
 
424 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 
486 aa  219  5e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
408 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
545 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
545 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
545 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 
545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
516 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.17 
 
 
530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 
539 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 
532 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
519 aa  123  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 
532 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
547 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
562 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
537 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  29.52 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.5 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  29.17 
 
 
545 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
531 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
537 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
546 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 
548 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  26.76 
 
 
520 aa  109  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.2 
 
 
525 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
542 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 
566 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
528 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
534 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
577 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
574 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
546 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  26.32 
 
 
543 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
545 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
559 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  29.62 
 
 
559 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
546 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 
559 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
552 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
543 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 
479 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
579 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
525 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
579 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.24 
 
 
529 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
578 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>