More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1004 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  100 
 
 
543 aa  1116    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 
554 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.86 
 
 
573 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.86 
 
 
557 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.18 
 
 
557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 
557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  48.02 
 
 
564 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  46.64 
 
 
560 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  46.26 
 
 
560 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.26 
 
 
560 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  46.26 
 
 
560 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  46.26 
 
 
560 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  45.67 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  45.64 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.26 
 
 
560 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  46.05 
 
 
560 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  46.25 
 
 
560 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  45.47 
 
 
560 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  35.09 
 
 
609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
556 aa  253  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
566 aa  247  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
537 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 
579 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
543 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
529 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 
539 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
547 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  31.03 
 
 
700 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.02 
 
 
532 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
545 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
532 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
532 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 
537 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
528 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
579 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
574 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.38 
 
 
530 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
582 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
548 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
533 aa  229  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
603 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
639 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
573 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 
572 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
562 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
534 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
531 aa  226  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
542 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 
600 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0094  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
519 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
504 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  39.27 
 
 
585 aa  223  9e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.73 
 
 
587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.36 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.74 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.5 
 
 
525 aa  220  7e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
525 aa  219  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
504 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
584 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
582 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
569 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  31.33 
 
 
545 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.82 
 
 
503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
585 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.8 
 
 
585 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
516 aa  216  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
581 aa  216  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
514 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
503 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
603 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 
546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
526 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
543 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30 
 
 
640 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
568 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.68 
 
 
491 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 
495 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.34 
 
 
567 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
550 aa  210  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
578 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.8 
 
 
502 aa  209  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
546 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.62 
 
 
513 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 
576 aa  208  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.06 
 
 
557 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.22 
 
 
516 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
540 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  30.71 
 
 
798 aa  207  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.97 
 
 
511 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.55 
 
 
503 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
573 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>