More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0949 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.12 
 
 
557 aa  642    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  97.86 
 
 
560 aa  1097    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  97.14 
 
 
560 aa  1089    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  97.14 
 
 
560 aa  1088    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  97.14 
 
 
560 aa  1088    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  97.32 
 
 
560 aa  1090    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  97.14 
 
 
560 aa  1089    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  96.96 
 
 
560 aa  1085    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  97.14 
 
 
560 aa  1088    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  88.87 
 
 
560 aa  1001    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  65.03 
 
 
557 aa  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
560 aa  1151    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  67.15 
 
 
554 aa  742    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  97.68 
 
 
560 aa  1093    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.31 
 
 
557 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.31 
 
 
573 aa  632  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  57.98 
 
 
564 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  45.81 
 
 
543 aa  468  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  39.07 
 
 
609 aa  389  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
532 aa  277  4e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  33.39 
 
 
531 aa  264  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
516 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.03 
 
 
525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
567 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
530 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
525 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
546 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
574 aa  257  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  32.3 
 
 
545 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 
539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  37.66 
 
 
566 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
548 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 
537 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
603 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
537 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 
532 aa  248  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
543 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
519 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
579 aa  246  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
582 aa  246  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 
529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
543 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
542 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
600 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
556 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
573 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.3 
 
 
591 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 
577 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 
546 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
584 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
524 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
595 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  31.55 
 
 
798 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.76 
 
 
587 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.21 
 
 
567 aa  234  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  38.01 
 
 
517 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
572 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 
528 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  37.77 
 
 
520 aa  232  2e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 
546 aa  232  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
519 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
582 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  30.85 
 
 
700 aa  230  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
576 aa  230  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  33.82 
 
 
602 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
536 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
518 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
534 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
519 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35 
 
 
526 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.51 
 
 
605 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.76 
 
 
585 aa  227  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
543 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
574 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
536 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
579 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
552 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
579 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
583 aa  224  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
579 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.93 
 
 
554 aa  223  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
593 aa  223  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
547 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 
603 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
507 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
585 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.9 
 
 
507 aa  219  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
575 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
639 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 
540 aa  217  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>