More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0868 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  86.15 
 
 
557 aa  977    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
557 aa  1144    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  59.53 
 
 
557 aa  661    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  86.15 
 
 
573 aa  975    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  62.13 
 
 
554 aa  676    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  58.12 
 
 
560 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  58.2 
 
 
560 aa  631  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  58.3 
 
 
560 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  57.76 
 
 
560 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  57.76 
 
 
560 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.76 
 
 
560 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.76 
 
 
560 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  57.76 
 
 
560 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  57.76 
 
 
560 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  57.94 
 
 
560 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  57.22 
 
 
560 aa  628  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  56.76 
 
 
564 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  46.18 
 
 
543 aa  477  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0274  alpha-glycerophosphate oxidase  38.76 
 
 
609 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
543 aa  286  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
567 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
546 aa  281  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  32.55 
 
 
545 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.19 
 
 
530 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
542 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
531 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
556 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
539 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
525 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.28 
 
 
532 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.97 
 
 
525 aa  268  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  30.85 
 
 
700 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
579 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
537 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
537 aa  264  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
543 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 
566 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
579 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.93 
 
 
587 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
548 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
582 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.04 
 
 
605 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
543 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
536 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
574 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
533 aa  252  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  39.36 
 
 
529 aa  250  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
532 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
519 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
532 aa  247  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
545 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 
573 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
603 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
546 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.36 
 
 
585 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
546 aa  243  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.09 
 
 
640 aa  243  7.999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 
524 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
578 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 
518 aa  240  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
577 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
526 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
576 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
582 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
528 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  32.78 
 
 
798 aa  238  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
569 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 
552 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  31.89 
 
 
600 aa  236  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  33.02 
 
 
520 aa  236  7e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
547 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
576 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 
583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
516 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.87 
 
 
554 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
579 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
579 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
527 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
579 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
568 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  34.78 
 
 
517 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
573 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  33.91 
 
 
585 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
572 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
519 aa  231  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
536 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
603 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30 
 
 
567 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
639 aa  230  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
534 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
552 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.16 
 
 
526 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.25 
 
 
591 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
581 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
585 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
595 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
584 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
582 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
579 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>