More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0359 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
526 aa  1051    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
527 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.08 
 
 
526 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
532 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
523 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
551 aa  363  4e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 
551 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.69 
 
 
461 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 
529 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 
519 aa  250  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.54 
 
 
573 aa  246  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.54 
 
 
557 aa  246  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
546 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.54 
 
 
557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 
516 aa  242  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 
534 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 
554 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 
524 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
525 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  30.61 
 
 
543 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.14 
 
 
525 aa  236  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.21 
 
 
591 aa  234  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
556 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  37.52 
 
 
532 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 
533 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 
532 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
566 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
564 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
536 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
528 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 
545 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
567 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
495 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
557 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.15 
 
 
530 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
540 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 
560 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
519 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
579 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 
543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.28 
 
 
560 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.28 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.28 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 
560 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  32.72 
 
 
602 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 
537 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  32.51 
 
 
545 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 
582 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 
550 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
579 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
569 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
502 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
546 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
548 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
518 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
502 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
531 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  31.37 
 
 
559 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 
568 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.58 
 
 
582 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
502 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  29.79 
 
 
520 aa  203  5e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
522 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
603 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
557 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
520 aa  202  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
575 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
639 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
537 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.01 
 
 
500 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.68 
 
 
499 aa  200  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.98 
 
 
500 aa  199  9e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.95 
 
 
507 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
536 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  32.09 
 
 
585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  27.62 
 
 
700 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.95 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
600 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.4 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.81 
 
 
585 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 
532 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
491 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
576 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 
573 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 
523 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.16 
 
 
554 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
559 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
579 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>