More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0200 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2628  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.53 
 
 
542 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.710716  normal  0.455755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02167  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)-binding  72.8 
 
 
542 aa  772    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1418  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  72.8 
 
 
542 aa  772    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556923  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.73 
 
 
542 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02126  hypothetical protein  72.8 
 
 
542 aa  772    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3991  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  79.04 
 
 
551 aa  846    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.172557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  78.61 
 
 
547 aa  859    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0341607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2539  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.8 
 
 
542 aa  772    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0686  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  65.1 
 
 
547 aa  695    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2420  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.53 
 
 
542 aa  771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2393  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.99 
 
 
542 aa  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2469  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.73 
 
 
542 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.357992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2623  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.8 
 
 
542 aa  772    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3378  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.8 
 
 
542 aa  772    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0227  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  79.41 
 
 
551 aa  851    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3957  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  85.05 
 
 
556 aa  939    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2524  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.73 
 
 
542 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2382  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.8 
 
 
542 aa  772    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0512  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  70.37 
 
 
562 aa  749    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000682192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0200  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  100 
 
 
547 aa  1110    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1410  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  72.61 
 
 
542 aa  769    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0397  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  62.29 
 
 
560 aa  672    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4148  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  84.81 
 
 
556 aa  933    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00376439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2805  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  74.21 
 
 
542 aa  788    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0248  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  89.55 
 
 
552 aa  947    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0402203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  54.73 
 
 
552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3299  FAD dependent oxidoreductase  45 
 
 
559 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1521  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  46.21 
 
 
535 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0946096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4111  FAD dependent oxidoreductase  44.03 
 
 
556 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0402229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2622  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 
514 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0001851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0071  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.07 
 
 
556 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2844  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
533 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2962  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.99 
 
 
556 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 
522 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1228  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 
516 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.677137  normal  0.683893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0933  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.13 
 
 
556 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0218972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.78 
 
 
512 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.150536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2516  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  42.02 
 
 
572 aa  365  1e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
539 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1471  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.41 
 
 
585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.390324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  40.66 
 
 
582 aa  352  1e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0332  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1177  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
435 aa  292  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  44.27 
 
 
407 aa  282  9e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1127  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
384 aa  273  6e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3076  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 
408 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1126  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
392 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
432 aa  243  7e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000252779  normal  0.373628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
545 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1419  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 
545 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
545 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0583  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
389 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6721  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1317  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
545 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5204  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
424 aa  233  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0880  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
486 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
543 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
547 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
556 aa  157  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 
574 aa  154  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
545 aa  153  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
546 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  31.58 
 
 
559 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
576 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 
559 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 
562 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
584 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
519 aa  133  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.97 
 
 
551 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.83 
 
 
591 aa  133  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
581 aa  133  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 
585 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  31.32 
 
 
585 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 
579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
525 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
575 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
576 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 
543 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
527 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
583 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
600 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.81 
 
 
605 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.85 
 
 
554 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
582 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 
526 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
573 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
566 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
533 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.27 
 
 
525 aa  124  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>