More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2156 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  65.29 
 
 		 502 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  64.89 
 
 		 503 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 517 aa  1063    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  67.41 
 
 		 495 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  65.48 
 
 		 502 aa  678    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  65.48 
 
 		 502 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  63.94 
 
 		 502 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.18 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.78 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.89 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.69 
 
 		 525 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.46 
 
 		 557 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.02 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.9 
 
 		 509 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.31 
 
 		 509 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.66 
 
 		 525 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.92 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.8 
 
 		 496 aa  508  1e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.37 
 
 		 516 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.59 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.22 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.88 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.44 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.84 
 
 		 510 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.06 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.45 
 
 		 510 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2990  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.78 
 
 		 524 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.45 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.46 
 
 		 504 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.67 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54 
 
 		 504 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.25 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.45 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.82 
 
 		 509 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.55 
 
 		 503 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.25 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.25 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.25 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.95 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.8 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0094  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.56 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.06 
 
 		 509 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.86 
 
 		 508 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.95 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.1 
 
 		 507 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.33 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.99 
 
 		 495 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.3 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.24 
 
 		 547 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.49 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.89 
 
 		 511 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.04 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.49 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3531  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  53.2 
 
 		 534 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.959942  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.77 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.2 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.71 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.33 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.96 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.29 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.42 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.21 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.33 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4642  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.64 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.42 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.45 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0152  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.48 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.48 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.469076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.88 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4000  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.48 
 
 		 504 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.04 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4393  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.19 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.98 
 
 		 505 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.41 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.31 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2602  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.31 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  54.77 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.37 
 
 		 526 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.5 
 
 		 510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.07 
 
 		 500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0630  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.71 
 
 		 531 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.86 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.49 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.78 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.64 
 
 		 512 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 507 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.06 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 507 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3684  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.42 
 
 		 515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3793  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.15 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.3143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3896  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.15 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.758553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3727  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.15 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3718  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.15 
 
 		 502 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.42 
 
 		 519 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>