More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5316 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  66.84 
 
 		 566 aa  768    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 581 aa  1177    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  44.88 
 
 		 587 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  42.68 
 
 		 582 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.47 
 
 		 582 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 562 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 600 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 		 616 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 543 aa  263  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 550 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 576 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 		 551 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 552 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.95 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.34 
 
 		 591 aa  190  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 582 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 547 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27 
 
 		 506 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 574 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.46 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27 
 
 		 506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  28.7 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.1 
 
 		 507 aa  177  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 516 aa  176  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.17 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2990  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.85 
 
 		 524 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.28 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 639 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.05 
 
 		 503 aa  174  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.71 
 
 		 507 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.05 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.67 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.38 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.6 
 
 		 495 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 577 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.54 
 
 		 512 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 584 aa  170  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.08 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.9 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 518 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.46 
 
 		 502 aa  167  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 603 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.14 
 
 		 583 aa  166  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.46 
 
 		 512 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.47 
 
 		 512 aa  166  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 564 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.74 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.89 
 
 		 605 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.71 
 
 		 502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.49 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 		 573 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.89 
 
 		 526 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 510 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.46 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 510 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 510 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.3 
 
 		 510 aa  165  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.06 
 
 		 510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 568 aa  164  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.11 
 
 		 510 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 574 aa  163  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.46 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.11 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.06 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.76 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 554 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.52 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.64 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.44 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.87 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 582 aa  160  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.13 
 
 		 507 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.22 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4393  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.06 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 531 aa  160  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.86 
 
 		 514 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.33 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 579 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4000  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.17 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.02 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0152  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.17 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.77 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.29 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>