More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3608 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  74.01 
 
 		 582 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 562 aa  1134    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  70.45 
 
 		 582 aa  805    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  50.56 
 
 		 571 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.65 
 
 		 581 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 616 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 543 aa  253  5.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 550 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 545 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 536 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.27 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.65 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.08 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.89 
 
 		 551 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.4 
 
 		 516 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 547 aa  178  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.19 
 
 		 526 aa  173  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.6 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.59 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.4 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.26 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 531 aa  170  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.98 
 
 		 512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 507 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.75 
 
 		 507 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.54 
 
 		 512 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 567 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.41 
 
 		 510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 501 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  30.31 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  30.31 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 501 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.4 
 
 		 499 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.2 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.49 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.43 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.46 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29 
 
 		 502 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.97 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.31 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 533 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.66 
 
 		 547 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.11 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.11 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.97 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.45 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.07 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.11 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.11 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.78 
 
 		 514 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.89 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.33 
 
 		 500 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.07 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 546 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  27.4 
 
 		 545 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 566 aa  160  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 577 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2602  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.95 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.64 
 
 		 526 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.04 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.53 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.26 
 
 		 502 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.44 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.73 
 
 		 591 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 532 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.04 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.28 
 
 		 573 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.5 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  24.47 
 
 		 557 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.95 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.71 
 
 		 605 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>