More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1192 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 571 aa  1167    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 582 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  50.54 
 
 		 562 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.73 
 
 		 582 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.1 
 
 		 581 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 616 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 600 aa  350  5e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 536 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 550 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.67 
 
 		 551 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 576 aa  203  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.98 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 516 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.59 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 543 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.11 
 
 		 526 aa  183  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 518 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  30 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 552 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.51 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 531 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.66 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.41 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.02 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.02 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.02 
 
 		 507 aa  174  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 532 aa  174  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.09 
 
 		 525 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 537 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.48 
 
 		 502 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 533 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.52 
 
 		 495 aa  171  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.99 
 
 		 517 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 574 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 582 aa  170  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 566 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.82 
 
 		 507 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 578 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.92 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.74 
 
 		 591 aa  166  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.84 
 
 		 567 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.91 
 
 		 509 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.23 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  30.8 
 
 		 517 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 560 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.94 
 
 		 531 aa  163  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.51 
 
 		 509 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 504 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 		 506 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 		 506 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 356 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.28 
 
 		 509 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.77 
 
 		 605 aa  161  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.21 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.9 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  25.87 
 
 		 700 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 543 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.31 
 
 		 511 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.32 
 
 		 511 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.95 
 
 		 510 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.1 
 
 		 503 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.4 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 583 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 639 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.05 
 
 		 640 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.02 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.46 
 
 		 499 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.19 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.72 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.48 
 
 		 513 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  28.62 
 
 		 798 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.67 
 
 		 499 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 536 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.43 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3684  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.81 
 
 		 515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.72 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.72 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.72 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>