More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5159 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  74.4 
 
 		 582 aa  890    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 582 aa  1188    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  74.01 
 
 		 562 aa  838    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  49.27 
 
 		 571 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  43.35 
 
 		 566 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.47 
 
 		 581 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  41.85 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 616 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 587 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 550 aa  250  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 556 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 536 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 552 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 552 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.54 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.73 
 
 		 551 aa  183  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.33 
 
 		 591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 567 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.1 
 
 		 516 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.96 
 
 		 557 aa  176  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 557 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  28.89 
 
 		 545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.82 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 546 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 573 aa  171  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 516 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.45 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 527 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.84 
 
 		 507 aa  166  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 528 aa  165  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.6 
 
 		 605 aa  164  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.65 
 
 		 507 aa  163  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 532 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.06 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.98 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.01 
 
 		 557 aa  161  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.04 
 
 		 514 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.7 
 
 		 526 aa  161  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 518 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.72 
 
 		 507 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 532 aa  160  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 582 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.51 
 
 		 531 aa  160  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.16 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.15 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.33 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.78 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4393  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.79 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.17 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 534 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.25 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.02 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 603 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.06 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.64 
 
 		 502 aa  158  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.05 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.82 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 639 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.58 
 
 		 512 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.51 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.09 
 
 		 512 aa  157  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  29.64 
 
 		 559 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.47 
 
 		 513 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 566 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 603 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.95 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.44 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 542 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.96 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 577 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 		 501 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.72 
 
 		 504 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 		 501 aa  154  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 		 501 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.05 
 
 		 510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 524 aa  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.71 
 
 		 495 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.44 
 
 		 505 aa  153  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 356 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3835  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.34 
 
 		 502 aa  153  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>