More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0601 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0601  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 512 aa  1065    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  64.44 
 
 		 519 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  66.87 
 
 		 515 aa  619  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002673  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  64.83 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.49 
 
 		 512 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4534  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.78 
 
 		 512 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443601  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.08 
 
 		 495 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3348  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.92 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.79 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1559  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.08 
 
 		 547 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1073  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.32 
 
 		 514 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.77 
 
 		 509 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4339  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.02 
 
 		 508 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.50517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17930  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.46 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  58.32 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.32 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1114  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.32 
 
 		 512 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.778652 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.52 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.32 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  58.32 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.32 
 
 		 501 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.52 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  58.12 
 
 		 501 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.32 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  58.1 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.56 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.56 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3718  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4000  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.92 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4123  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.7 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.469076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0152  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.92 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3793  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.3143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3727  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3896  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.758553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3834  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.96 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.867048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.7 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4642  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  55.65 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3835  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.36 
 
 		 502 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0230057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  57.43 
 
 		 501 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  56.2 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.1 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.74 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.06 
 
 		 502 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.85 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.01 
 
 		 516 aa  475  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.43 
 
 		 502 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.86 
 
 		 510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2574  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.74 
 
 		 495 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.78 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.29 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.49 
 
 		 507 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.27 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.06 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  49.19 
 
 		 504 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.19 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.22 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.56 
 
 		 517 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.52 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0094  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.12 
 
 		 516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.65 
 
 		 509 aa  445  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4393  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.33 
 
 		 527 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.67 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.99 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.69 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.43 
 
 		 511 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.67 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1143  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.17 
 
 		 500 aa  435  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2980  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.83 
 
 		 525 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.12 
 
 		 513 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.4 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.24 
 
 		 525 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0082196  normal  0.374558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.9 
 
 		 509 aa  435  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1013  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.33 
 
 		 496 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.537969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.27 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.21 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.04 
 
 		 504 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.75 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.35 
 
 		 511 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2990  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.64 
 
 		 524 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.38 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0639  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.99 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1208  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.29 
 
 		 534 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.397297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2670  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.59 
 
 		 539 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.79 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.15 
 
 		 514 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.59 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2206  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.4 
 
 		 526 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.440136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.36 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.2 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.18 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3684  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.21 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0630  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  43.09 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.65 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.88 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.64 
 
 		 526 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.71 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.11 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3531  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  48.59 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.959942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.11 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>